(一)沙眼：由衣原體沙眼生物變種A、B、Ba、C血清型引起。主要經(jīng)直接或間接接觸傳播，即眼～眼或眼～手～眼的途經(jīng)傳播。當沙眼衣原體感染眼結膜上皮細胞后，在其中增殖并在胞漿內(nèi)形成散在型、帽型、桑椹型或填塞型包涵體。該病發(fā)病緩慢，早期出現(xiàn)眼瞼結膜急性或亞急性炎癥，表現(xiàn)流淚、有粘液膿性分泌物、結膜充血等癥狀與體征。后期移行為慢性，出現(xiàn)結膜瘢痕、眼瞼內(nèi)翻、倒睫、角膜血管翳引起的角膜損害，以致影響視力，最后導致失明。據(jù)統(tǒng)計沙眼居致盲病因的首位。1956年我國學者湯飛凡等人用雞胚*黃囊接種法，在世界上首次成功地分離出沙眼衣原體，從而促進了有關原體的研究。

(二)包涵體包膜炎：由沙眼生物變種D～K血清型引起。包括嬰兒及成人兩種。前者系嬰兒經(jīng)產(chǎn)道感染，引起急性化膿性結膜炎(包涵體膿漏眼)，不侵犯角膜，能自愈。成人感染可因兩性接觸，經(jīng)手至眼的的途徑或者來自污染的游泳池水，引起濾泡性結膜炎又稱游泳池結膜炎。病變類似沙眼，但不出現(xiàn)角膜血管翳，亦無結膜瘢痕形成，一般經(jīng)數(shù)周或數(shù)月痊愈，無后遺癥。

(三)泌尿生殖道感染：經(jīng)性接觸傳播，由沙眼生物變種D～K血清型引起。男性多表現(xiàn)為尿道炎，不經(jīng)治療可緩解，但多數(shù)轉變成慢性，周期性加重，并可合并副睪炎、直腸炎等。女性能引起尿道炎、宮頸炎等，輸*管炎是較嚴重并發(fā)癥。該血清型有時也能引起沙眼衣原體性肺炎。