藥物一：抗病毒藥：可用百分之五酞丁胺霜劑，或用百分之二點五皰疹凈軟膏，每日2次，外涂。阿昔洛韋口服，每日5次，每次200，或其軟膏外用。α-干擾素每日注射300萬u，每周用藥5天或干擾素300萬u注入疣體基部，每周2次。連用2~3周，主要副作用為流感樣綜合征，局部用藥副作用較少且輕微。

藥物二：腐蝕劑或消毒劑：常用的有百分之三十~百分之五十三氯醋酸或飽和二氯醋酸，或百分之十八過氧乙酸，用于龜頭、肛周濕疣，每日或隔日一次，效果甚好。消毒劑可用百分之二十碘酊外涂，或用新潔爾滅外涂，后者需配合全身療法。

藥物三：足葉草酯(尤脫欣、鬼臼毒素、疣迪)：適用于濕潤區(qū)域的濕疣，如發(fā)生在龜頭及會陰部的濕疣。宮頸尖銳濕疣不能用足葉草酯治療。概要是國外用于本病治療的首選藥物，一般一次可愈。但有很多缺點，如對組織破壞性大，使用不當可引起局部潰瘍;毒性大，主要表現(xiàn)為惡心、白細胞及血小板減少，心動過速、尿閉或少尿，故使用時必須謹慎。